Plusieurs siècles après la chute de Revan, l'Empereur Vitiate qui dominait le nouvel Empire Sith depuis plus d'un millénaire mit en marche son plan de conquête de la galaxie et envoya ses forces reprendre Korriban dans une violente attaque surprise, qui anéantit rapidement les forces de la République Galactique en faction sur les lieux. La planète fut ainsi reconquise par de puissants guerriers tels que Dark Malgus, et l'Académie fut rebâtie pour permettre à une nouvelle génération d'émerger, prête à combattre dans la grande guerre galactique déclenchée par cet assaut. Pendant des décennies, les Sith mirent ainsi un point d'honneur à restaurer la gloire de Korriban tandis que la guerre faisait rage dans la galaxie, les Jedi n'osant plus tenter de reprendre ce berceau de l'Ordre Sith.
En – 3653, le Traité de Coruscant fut signé et une paix fragile s'instaura, permettant à Korriban de donner tout son potentiel, de produire une foule d'acolytes plus redoutables les uns que les autres et d'explorer les anciens tombeaux des Seigneurs Noirs qui recelaient de secrets plus dangereux et obscurs les uns que les autres. De véritables légendes de la guerre passèrent ainsi par Korriban au cours de leur formation, comme la Furie de l'Empire ou le conseiller Noir Dark Nox.
Quelques années après la rupture du Traité, en – 3638, la République lança une attaque massive sur Korriban, dans le cadre d'un vaste plan orchestré dans l'ombre par le puissant Revan, et la planète fut de nouveau dévastée. Elle n'eut cependant pas le temps de se remettre de ses blessures malgré le retrait des forces républicaines, car l'Empire Eternel fit son apparition dans la galaxie et fit plier le berceau des Sith au cours de l'assaut le plus violent jamais connu par Korriban. Il fallut attendre des décennies pour que la planète recouvre un certain éclat, mais elle demeura silencieuse pendant des siècles après la fin de la guerre...