Revan, redevenu Jedi, avait encore des trous de mémoire concernant son passage dans le côté obscur et il était persuadé qu'une étrange menace planait à nouveau sur la République.
Il partit alors, avec T3-M4, en quête de son passé. Mais il fut capturé par Dark Nyriss et Scourge lorsqu'il atterrit sur Nathema. Les deux Sith l'enfermèrent sur Dromund Kaas dans la forteresse de Dark Nyriss pendant plusieurs années.
Dans le même temps, une faction annexe de l’Empire Sith de Dark Revan refit surface. Cette faction s’appelait le Triumvirat Sith, et était menée par trois Seigneurs Sith : Dark Traya, Dark Nihilus, et Dark Sion. Cependant, Meetra Surik, une Jedi vétéran des Guerres Mandaloriennes appelée également l’Exilée, déjoua les plans du Triumvirat et tua les trois Seigneurs Sith avant de détruire la planète Malachor V. Lorsqu'elle entendit parler de la disparition de Revan, elle partit immédiatement à sa recherche. Meetra fut aidée de T3-M4 qui avait réussi à s'enfuir de Nathema et ils arrivèrent ensemble sur Dromund Kaas.
Scourge, qui commençait à douter des décisions de l'Empereur, fit la connaissance de l'Exilée. Elle lui révéla ses intentions et lui, voyant une opportunité d’accroître son pouvoir, accepta de l'aider. Il dénonça Dark Nyriss pour trahison, et l'Empereur envoya la Garde Impériale détruire la Sith et ses partisans. Profitant du chaos ambiant, Meetra et Scourge libérèrent Revan.
Cependant, l'Empereur ne se contenta pas seulement d'éliminer Nyriss. Il élimina tous les membres du Conseil Noir afin d'éradiquer tout signe de trahison.
Constatant la puissance de Vitiate et la folie qui l'avait poussé à détruire Nathema, les deux Jedi, T3-M4 ainsi que Scourge s'attaquèrent alors à l'Empereur. Revan, dont les souvenirs étaient réapparus, vit clair dans les intentions de ce dernier et il se jeta dans un face à face mortel.
Ils combattirent tous avec rage, mais T3-M4 explosa en des milliers de morceaux
par la puissance de l'Empereur lorsqu'il essaya de sauver Revan. Le corps à moitié brûler, ce dernier se jeta néanmoins sur Vitiate, aidé par Meetra et Scourge. Au dernier moment, Scourge, convaincu qu'ils allaient tous mourir face au Seigneur Noir, changea de camp et il enfonça sa lame dans le dos de l'Exilée. Pris au dépourvu, Revan fut projeté dans les airs par l'Empereur et il perdit connaissance.
Vitiate accorda alors à Scourge le titre de Furie de l'Empereur, ainsi que l'immortalité grâce à un nouveau rituel qu'il avait mis au point. Le Sith accepta, ce qui lui laisserait suffisamment de temps pour réfléchir à la chute de l'Empereur.
Quant à Revan, il fut enfermé dans la prison Maelström. Immobilisé et maintenu inconscient par d'anciennes sorcelleries Sith, il fut surveillé en permanence par l'Empereur qui avait lié son esprit au sien. Vitiate espérait ainsi garder un total contrôle sur ce puissant Jedi, persuadé qu'il lui serait encore utile. Néanmoins, soutenu par l'esprit de Meetra, Revan tenta d'influencer les pensées du Seigneur Noir, espérant parvenir à lui faire épargner la République.
Pendant les mois qui suivirent la mort de son avatar, l'Empereur continua de tirer quelques ficelles par le biais de ses Mains, notamment en donnant des instructions à sa nouvelle Furie, mais il finit par se retirer sur Yavin IV pour reprendre des forces, laissant la galaxie à ses conflits qui furent pour beaucoup des conséquences de sa disparition, à l'exemple de Dark Malgus, ses anciens Enfants ou de la Guerre d'Effroi. Mais en – 3638, l'Ordre de Revan émergea, mené par son ancien adversaire revenu d'entre les morts et dont l'objectif était de rappeler l'esprit de Vitiate pour l'éliminer une fois pour toutes. En dépit de la folie de ce plan, Revan aurait pu réussir sans l'intervention de Dark Marr et de Satele Shan qui anéantirent les révanites sur Yavin IV, créant un bain de sang suffisant pour permettre à l'Empereur de se réveiller et de s'échapper vers les étoiles sous forme d'essence de Force, assoiffé de pouvoir. Seul contre la galaxie, l'esprit de Vitiate trouva refuge sur Ziost où il s'empara de nombreux esprits, créant un véritable chaos sur la planète Sith qui plongea dans la guerre civile, situation rapidement envenimée par l'arrivée des Jedi de la Sixième Ligne et de la République Galactique. Toutefois, Lana Beniko et Theron Shan avaient permis à un puissant adversaire de venir sur Ziost pour confronter l'Empereur, poussant ce dernier à aspirer toute vie à la surface et ne laisser qu'un monde dévasté. Rassasié, il décida alors de se retirer dans son ultime corps physique qu'il travaillait depuis des siècles, Valkorion.
En effet, loin de Dromund Kaas ou de Ziost se trouvait la planète Zakel, cachée au sein de l'Espace Sauvage. Longtemps régie par d'antiques divinités et sur une culture tribale, elle fut découverte par l'Empereur pendant qu'il préparait son attaque de la République et il s'empara du corps d'un puissant guerrier du nom de Valkorion, icône pour son peuple. Sous cette identité, il devint alors en parallèle de son Empire Sith l'Empereur Immortel de l'Empire Eternel de Zakel, une puissance nouvelle et émergente qu'il fortifia pendant des siècles pour construire la société idéale et l'ultime civilisation de l'histoire galactique. Etudiant les secrets de l'Espace Sauvage, il découvrit également la redoutable Flotte Eternelle qui fit de son Empire l'une des forces les plus puissantes de la galaxie, et forgea une nouvelle mythologie autour de sa personne. Il mit en place énormément de choses et fut rapidement reconnu comme une figure bienveillante pour Zakel, trouvant même un certain équilibre au sein de la Force et créant une famille. Avec l'une de ses Chevaliers, Senya Tirall, Valkorion eut trois enfants puissants dans la Force, les jumeaux Arcann et Thexan et l'incroyable Vaylin. Il imposa par ailleurs à cette dernière un redoutable conditionnement mental pour dompter ses capacités capables de rivaliser avec celles de l'Empereur Immortel. Pendant de longues années, il régit sa société idéale sans trop d'accrocs, jusqu'en – 3637 où tout changea. Les événements de Ziost poussèrent Vitiate à se replier sur Zakel et Valkorion devint l'unique entité représentant l'enfant de Nathema, coupé de tous ses anciens liens avec la galaxie et l'Empire Sith. Mais cela n'empêcha pas Dark Marr de le poursuivre jusqu'à l'Espace Sauvage, ce qui poussa ses jumeaux à mener une opération offensive contre la République et les Sith pour impressioner leur père, en dépit des réticences de ce dernier. Cela mena à la capture de Dark Marr et de ses alliés, dont l'individu qui s'était opposé à lui sur Ziost et qui était appelé à devenir l'Etranger. Valkorion rencontra alors les prisonniers dans sa salle du Trône où il leur demanda de se soumettre à lui. Naturellement, Dark Marr refusa et tenter de l'éliminer, forçant Valkorion à l'exécuter, mais l'Etranger connut un sort bien différent. L'ambition et la haine d'Arcann avaient en effet vu une opportunité chez ce puissant combattant et le fils de l'Empereur utilisa le prisonnier pour obtenir ce qu'il désirait tant: l'assassinat de Valkorion. Son dernier corps physique fut alors éliminé, obligeant l'Empereur à rattacher son essence au seul esprit puissant à proximité, l'Etranger lui-même. Arcann s'auto-proclama alors Empereur tandis que Valkorion et l'Etranger étaient enfermés dans la carbonite. Enfermé dans le corps de son hôte mais incapable de prendre possession de son corps comme il l'avait pour Valkorion, l'ancien Empereur Sith fomenta un plan sur le long terme pour reprendre son Trône, décidant d'aider l'Etranger à lutter contre ses enfants.
Cinq années après la destruction de son corps, Valkorion s'éveilla de nouveau lorsque l'Etranger fut libéré de la carbonite par ses alliés Lana Beniko et T7-01. Naturellement, l'Empereur Immortel avait profité de cette période pour manipuler les sentiments de son hôte, afin de commencer à le préparer pour reprendre son Trône, mais commença par se faire discrèt. Il suivit avec curiosité les efforts de l'Etranger et ses alliés pour quitter Zakel et leur lutte dans les Marais Sans Fin pour faire décoller le légendaire Cénotaphe avant d'être retrouvés par les Chevaliers de Zakel d'Arcann. A sa grande surprise, son ancien amour Senya Tirall rallia le groupe disparate de l'Etranger lorsqu'ils rallièrent Asile, le dernier port spatial libre de l'influence de l'Empire Eternel où se cachaient de nombreux réfugiés de guerre. Tout au long de leur progression, Valkorion ne cessa de donner des indices à son hôte en lui proposant de temps à autre d'utiliser ses pouvoirs pour ses combats, mais on ignore si l'Etranger accepta de s'offrir ainsi à l'Empereur.
Une fois sur Asile, ils rencontrèrent les Descendants de Zakel qui révélèrent à tous la présence de l'esprit de Valkorion au sein de celui de l'Etranger, ce qui accentua le fanatisme de leur leader Heskal et le poussa à commettre une immense erreur. Suite au retour de l'Etranger de Zakel où il était parti recruter SCORPION, la Dame du Chagrin, Heskal avait attiré Arcann sur Asile pour une confrontation. A l'abri dans le corps de son hôte, Valkorion assista ainsi au premier véritable combat entre l'Etranger et Arcann, ce dernier déterminé à exterminer une fois pour toute l'Empereur Immortel après avoir senti sa présence. L'Etranger et ses alliés parvinrent finalement à survivre à l'attaque d'Arcann, la présence de Valkorion ayant probablement aidé, et l'Alliance anti-Zakel se forma sur Odessen. Pendant les mois qui suivirent, Valkorion se fit plus ou moins discrèt en assistant aux efforts de l'Etranger pour lutter contre l'Empire Eternel, jaugeant sa valeur pour savoir à quel moment le manipuler le plus efficacement, notamment lors d'une retraite du commandant de l'Alliance dans les jungles d'Odessen ayant pour objectif de communiquer directement avec l'esprit de Valkorion. A cette occasion, l'Empereur le confronta à ses faiblesses et à son destin, lui présentant la véritable nature de la Force qui fut appuyée par Satele Shan et l'esprit de Dark Marr présents sur Odessen, ce qui changea profondément l'Etranger, pour le plus grand plaisir de Valkorion. Il demeura ensuite plutôt silencieux jusqu'à l'apogée du conflit, lorsque l'Etranger confronta directement Arcann lors de la première bataille d'Odessen et parvint à le dominer.
Il le guida ensuite dans une véritable quête pour le Trône Eternel, guidant ses pas dans le conflit contre Vaylin qui avait pris la place d'Arcann et se montrant d'une grande aide face à cette force de la nature. Le véritable atout pour Valkorion fut le conditionnement qu'il avait mis en place dans l'enfance de sa fille et qui se révéla un temps une arme redoutable aux mains de l'Etranger, mais cela les conduisit sur Nathema, où tout avait commencé longtemps auparavant. Malheureusement pour eux, Vaylin parvint à s'y libérer de son conditionnement, relâchant toute sa puissance et sa noirceur qu'elle déversa sur la base de l'Alliance, forçant l'Etranger à y mener le combat de la dernière chance avec le soutien de Valkorion, lui-même presque dépassé par sa fille. Vaylin finit toutefois par succomber et le Trône redevint vacant, libérant la Flotte Eternelle qui se mit à ravager la galaxie. Manipulateur, Valkorion fit alors comprendre à l'Etranger que le seul moyen de ramener la paix une fois pour toutes était de s'emparer du Trône et il le poussa à se rendre sur Zakel. L'ingéniosité de son plan éclata alors, le Trône faisant office de catalyseur et permettant à Valkorion de s'emparer totalement du corps de l'Etranger, désormais l'individu le plus puissant de la galaxie et le vaisseau idéal pour son règne éternel. Une grande bataille mentale s'engagea alors, son hôte se révélant bien plus puissant que Valkorion ne l'avait envisagé, et il se retrouva à lutter également contre les esprits de Vaylin, Arcann et Senya, ainsi que son propre père, le Seigneur Dramath, dont le pouvoir avait été conservé dans un ancien holocron de Nathema. Acculé par ses ennemis, l'esprit de Valkorion mena une lutte désespérée à mesure qu'il comprenait que sa fin était proche, mais il ne put stopper l'Etranger de mettre un terme à son existence, effaçant définitivement son essence de la galaxie...
Ainsi s'acheva la vie de l'Empereur Immortel, au terme de près de 1300 ans d'existence.