Une série d'horribles pertes conduit la
Nouvelle République à commencer une étude approfondie sur la culture, la technologie, et la technique de combat utilisées par les
Yuuzhan Vong. Une alliance avec les
Vestiges de l’Empire dirigés par l'Amiral Gilad
Pellaeon est alors créée. Les militaires de la Nouvelle République acceptent également une mission de couverture sur
Garqi.
Faisant équipe avec un groupe de combattants résistants, une équipe des forces spéciales infiltre le camp des esclaves des Yuuzhan Vong et est le témoin d'horribles faits. Les esclaves humains sont perfectionnés afin de devenir des guerriers sans merci, certains presque entièrement recouverts par les pousses de corail yorik. Les Vong relâchent les esclaves à travers la ville puis les abattent avec l'aide des
Chazrach. Durant l'une de ces chasses, une bataille s'engage et l’équipe de la Nouvelle République tue beaucoup d'esclaves et de guerriers Yuuzhan Vong dont le commandant de Garqi,
Krag Val. Ils quittent la planète avec plusieurs des esclaves humains contaminés et une découverte encore plus grande : l’armure utilisée par les Yuuzhan Vong fait une allergie mortelle au pollen des arbres baffor provenant de la planète Ithor.
Sur Dubrillion, qui sert de quartier général Yuuzhan Vong pendant cette phase de l'invasion,
Elegos A'Kla de la Nouvelle République rencontre le Commandant
Shedao Shai afin de discuter de la possibilité d'une trêve voire même d'une paix durable. Après avoir appris directement la définition du mot douleur, Elegos est assassiné par
Shai afin d'envoyer un message au chevalier Jedi
Corran Horn, le guerrier qui a tué ses frères sur Bimmiel. Bien que le commandant ait beaucoup appris lors des moments passés avec le
Caamasi, d'autres Yuuzhan Vong croient que la Nouvelle République l'a perverti et complotent pour sa chute. Parmi eux le second de Shai,
Deign Lian, et son supérieur, le Maître de Guerre
Tsavong Lah.
Les Yuuzhan Vong préparent une diversion sur
Agamar alors qu'ils s'apprêtent à attaquer Ithor de toutes leurs forces dans l'espoir d'éliminer l'arme organique que la Nouvelle République doit utiliser contre eux. L'attaque a ainsi un impact autant psychologique que physique.
Unis contre un ennemi commun, les flottes alliées de la Nouvelle République et des
Vestiges de l'Empire se préparent à la défense d'Ithor et supervisent l'évacuation de ses habitants, les pacifistes Ithoriens. Avec le retour de l'Escadron Rogue d'une autre mission, ils apprennent que les Yuuzhan Vong ont commencé la construction d'un vaisseau de taille planétaire à partir des restes de
Sernpidal. Finalement, le message de Shedao Shai pour la Nouvelle République arrive dans une navette modifiée : ils ont un mois pour se préparer pour l'attaque d'Ithor. Les héros sont horrifiés de trouver le squelette plaqué or et couvert de bijoux de cérémonie d'Elegos A'Kla à l'intérieur de la navette, présentant un deuxième message à Corran
Horn : “rapportez les ossements de
Mongei Shai ou soyez détruits.”
Deign Lian est troublé que son commandant mène une guerre personnelle afin de regagner les ossements de son grand-père. Il assure avoir préparé une arme afin d'éliminer la menace sur Ithor, mais Shedao Shai insiste sur le fait qu’il souhaite mener en personne un assaut terrestre.
Quand le jour de l'attaque vient, la Nouvelle République se présente prête avec un grand nombre de vaisseaux, mais les Yuuzhan Vong le sont tout autant avec une flotte menée par le grand croiseur
Héritage de Tourments – un vaisseau-monde long de huit kilomètres. La flotte d'invasion comporte aussi trois croiseurs d'assaut et huit croiseurs légers, chacun avec un contingent complet de coraux skippers. Alors que la bataille arrive à son point culminant, le commandant des Yuuzhan Vong est contacté par Corran Horn afin de lui proposer un duel qui décidera du destin d'Ithor. Shedao Shai accepte et est tué au cours de ce duel. Deign Lian dirigeant à présent la flotte Yuuzhan Vong, les armes bactériologiques sont lancées. La bactérie métabolise rapidement toute forme de vie sur la planète et surchauffe l’atmosphère. La Nouvelle République réplique avec toute sa force de feu, détruisant
l'Héritage de Tourments et plusieurs vaisseaux plus petits. Alors que le grand croiseur est entraîné dans l'atmosphère, il se consume, mettant le feu à Ithor. La Nouvelle République a repoussé la flotte Yuuzhan Vong, mais Ithor est totalement détruite.