L’un des conflits majeurs fut la Guerre Civile
Aqualish qui commença à cause des Aqualas. Ces derniers accusèrent les deux autres peuples d’être responsables du déclin de la pêche de poissons. La guerre ne prit fin que lorsque les peuples durent s’unir pour faire fasse à des envahisseurs venus de l’espace. Ces envahisseurs semblent être des explorateurs Corelliens ou des
Duros. Ils apprirent les secrets des voyages galactiques grâce au vaisseau qu’ils avaient récupéré après avoir détruit leurs ennemis.
Vers 15 000 av BY, leurs voyages les conduisirent dans différents mondes voisins où ils affrontèrent les populations locales dans des affrontements sanglants. Ce conflit s’étendit et devint une guerre qui opposa les Aqualishs à la République et plus particulièrement aux Corelliens. Lorsqu’ils furent défaits, notamment en raison de leur manque d’expérience et leur manque de puissance de feu, leurs armées furent dissoutes.
Par la suite,
Ando rejoignit la
République Galactique, mais leurs conflits entachaient leur réputation malgré les tentatives de démilitarisation.
Les scientifiques de la République les aidèrent à trouver et régler le problème que causait le manque de poissons dans leurs océans. Par la suite, Ando devint la planète considérée comme ayant la meilleure qualité de poisson de la galaxie.
En 95 av BY, les Aqualishs avaient à leur compte, pas moins de 15 mondes colonisés. Par la suite, ces mondes formèrent les
Colonies Libres Andoan.
Durant la Guerre des Clones, le Sénateur de la planète,
Po Nudo, choisit de se séparer de la République pour se rapprocher de la
Confédération des Systèmes Indépendants, proche du Compte
Dooku. Pendant ce temps, les Colonies libres, représentées par le Sénateur Grothin Vagger, restaient loyales à la République.
Sous l’Empire de
Palpatine, Ando fut malmenée et pillée. Les Aqualishs se retournèrent contre lui et se battirent seuls plutôt que de se joindre à l’Alliance Rebelle. Elle rejoignit néanmoins la
Nouvelle République en 9 ap BY.
Durant la Guerre contre les
Yuuzhan Vong, vers 25 ap BY, le Maître de la Guerre Vong,
Tsavong Lah, proposa aux Aqualishs de les épargner s’ils détruisaient tous les droïdes et tuaient tous les Jedi d’Ando. Le Chevalier Jedi
Dorsk 82 fut tué, malheureusement pour Ando, elle fut tout de même envahie et piétinée par les extra-galactiques.