Dans une galaxie très, très lointaine commence un affrontement terrible entre le Bien et le Mal, l'innocence et le pouvoir. Alors que tout le monde croit la galaxie en paix, une menace terrible s'abat sur l'Univers. La Fédération du Commerce a secrètement conclu un pacte avec les redoutables Seigneurs Noirs des Sith pour envahir la planète Naboo et s'opposer ainsi à la République et au Sénat. Le Maître Jedi Qui-Gon Jinn et son jeune Padawan Obi-Wan Kenobi sont délégués auprès de la Reine Amidala, souveraine de Naboo, par le Conseil des Jedi pour faire face à la situation. Hélas, les choses tournent mal et la Reine est obligée de fuir, incognito, sous la protection des Chevaliers du Jedi. Cette fuite va les amener au devant de leur destin à tous, au devant du jeune Anakin Skywalker.

Depuis le blocus de la planète Naboo par la Fédération du commerce, la République, gouvernée par le Chancelier Palpatine, connaît une véritable crise. Un groupe de dissidents, mené par le Comte Dooku, un ancien Jedi, manifeste son mécontentement envers le fonctionnement du régime. Le Sénat et la population civile se montrent pour leur part inquiets face à l'émergence d'une telle menace. Certains sénateurs demandent à ce que la République soit dotée d'une solide armée pour empêcher que la situation ne se détériore davantage. Parallèlement, Padmé Amidala, devenue sénateur, est menacée par les Séparatistes et échappe de justesse à un attentat. Le Padawan Anakin Skywalker est chargé de sa protection. Son maître, Obi-Wan Kenobi, part enquêter sur cette tentative de meurtre et découvre la constitution d'une mystérieuse armée de clones...

Après trois ans d’incessants combats, la Guerre des Clones est sur le point de toucher à sa fin. Une franche hostilité oppose désormais le Chancelier Suprême Palpatine au Conseil Jedi, mais quand ce dernier se fait capturer par l’armée Séparatiste lors de l’attaque de Coruscant, c’est Obi-Wan Kenobi et Anakin Skywalker qui sont appelés pour aller à sa rescousse. L’Élu et son ancien Maître sont devenus les héros de la République. Plus que des amis, les deux frères sont sur le point de mettre un terme à la guerre mais ils ignorent qu’ils sont les acteurs du dernier acte d’une tragédie à l'échelle galactique. Séduits par les sombres enseignements de Palpatine, Anakin est sur le point de faire des choix qui détermineront non seulement son destin, mais aussi celui de la galaxie.

Le jeune Luke Skywalker découvre son destin lorsque, à la recherche d'un droïde égaré, il est sauvé par l'ermite Jedi Obi-Wan Kenobi. Alors que la guerre civile fait rage dans toute la galaxie et que les forces rebelles luttent contre l'Empire, Luke et Obi-Wan obtiennent l'aide d'un pilote d'élite, Han Solo accompagné de son copilote, le Wookiee Chewbacca. Avec le duo farfelu des droïdes C-3PO et R2-D2, cette troupe hétéroclite se lance à la rescousse de la Princesse Leia et va utiliser les plans volés pour détruire l'arme absolue de l'Empire : l'Etoile Noire. Au cours d'une confrontation légendaire, la téméraire équipe organise une attaque contre l'Etoile Noire et se prépare à un terrible combat contre le maléfique Seigneur Sith Dark Vador.

La bataille pour la galaxie s'intensifie. Tandis que les forces impériales lancent une attaque massive contre l'Alliance Rebelle, Han Solo et la Princesse Leia fuient vers la Cité des Nuages où ils sont capturés par Dark Vador. Luke Skywalker s'envole vers la mystérieuse et marécageuse planète Dagobah, où le sage Maître Jedi Yoda enseigne au héros les secrets de la Force. Luke ne se doute pas que son entraînement Jedi lui servira très bientôt. Une révélation de taille - et un duel à mort contre Dark Vador - l'attendent.

L’Empereur prépare sa nouvelle Etoile Noire à porter un coup fatal à l'Alliance Rebelle. Luke Skywalker rejoint ses alliés droïdes R2-D2 et C-3PO, ainsi que la Princesse Leia pour libérer son camarade Han Solo, toujours emprisonné par Jabba le Hutt. Une fois réunis, les Rebelles filent vers la planète Endor d'où ils déclenchent une attaque désespérée contre toute la flotte impériale. Mais le combat ultime oppose un père à son fils, car Luke fait face à Dark Vador une ultime fois, pour un duel dont dépend le sort de la galaxie.