Le jeu sera intégralement contrôlé au stylet. L'histoire, basée sur la série et le film, sera néanmoins originale. Le titre "Jedi Alliance" n'est pas anodin : au début de chaque mission, le joueur choisira un partenaire Jedi, l'interaction entre les personnages étant un élément essentiel du gameplay (on pense, récemment, à Lego Indiana Jones : The Original Adventures). Il sera possible de jouer en Wifi en mode coopératif.