Alors Revan de par sa connexion avec l'Empereur parvient à refreiner un peu ses ardeurs et le manipuler en parti - ce qui explique pourquoi l'invasion de la République mais 300 ans à venir. L'Empereur continue à diriger son Empire Sith, même si dans la pratique c'est plus le Conseil Noir qui gère les choses.
Revan est libéré au fil du jeu, et explique que ça va rendre l'Empereur plus dangereux mais j'ai pas l'impression que ça ait de réelles conséquences narratives. Suite à ça Revan part à la recherche d'un Lieu appelé la Forge mais pour la suite et fin c'est les classes Impériales et j'en suis pas là

. A noter aussi que Meetra est également présente sous forme d'esprit, guidant les joueurs vers Revan.
Sinon Scourge et l'Empereur sont au centre de l'histoire de la classe Chevalier Jedi. Scourge est devenu "la Colère de l'Empereur", une sorte d'homme de main/agent de confiance envoyé par l'Empereur pour toute chose délicate dans l'Empire. Mais en fait il n'a toujours qu'une envie renverser l'Empereur et attends donc l'apparition du Jedi qu'il a eu dans sa vision à la fin du bouquin. Ce Jedi c'est le héro de la classe chevalier Jedi, et il finit donc par rejoindre son camp et s'allier à lui/elle dans le but de vaincre l'Empereur.
Dans TOR l'Empereur prévoit une succession de rituels similaires à ceux qui l'ont déjà rendu immortel pour accroitre encore sa puissance, la conséquence étant la destruction de la Galaxie. Le Jedi et Scourge (et leurs autres compagnons) finissent par empêcher ses rituels, suite à quoi le héro s'infiltre sur Dromund Kass pour affronter l'Empereur en un contre un (la raison étant qu'il est le seul personnage qui parvient à résister au contrôle mental de l'Empereur), et à le vaincre. Par contre avant qu'il n'ait pu porter le coup de grâce, l'Empereur prend sa propre vie.
A ce stade du jeu (qui marque la fin de la classe Jedi), il est assumé que l'Empereur est mort, quant à Scourge il reste avec le Jedi étant maintenant la personne la plus haïe et recherchée de l'Empire pour sa trahison. Mais après il y a une quête à la fin de cette histoire suggérant que l'Empereur n'est peut être pas totalement mort - aucune réponse définitive, mais son retour n'est peut être pas à exclure dans de futurs extensions.