Excellent pilote de chasseur et officier de valeur, Jhoram Bey fut l’un des meilleurs officiers des Vestiges de l’Alliance Galactique durant la guerre contre les Sith. Respecté par ses hommes pour son sens moral et son talent, il était également connu pour sa discipline de fer. La meilleure expression en fut la bagarre entre Andurgo, un pilote Dug, et Hondo Karr, ancien Soldat de Choc ayant intégré l’escadron Rogue. Alors que les deux pilotes avaient sorti les couteaux, Bey s’interposa en proposant d’abattre les récalcitrants, et mit un terme à l’affrontement en renvoyant les spectateurs à leurs occupations. 

A la tête de l’escadron Rogue, Bey participa au combat qui permit à l’Alliance de s’emparer du Super-Destroyer Sith l’Impérieux dans les chantiers navals de Dac. Avec ses chasseurs Crossfire CF-9 , l’escadron d’élite de l’Alliance affronta une force supérieure en nombre de Predator-TIE, pendant que les vaisseaux lourds engageaient le combat contre les défenses Sith.

Lorsque le vaisseau-amiral de la flotte de l’Alliance, l’Indomptable, fut gravement touché, Jhoram Bey monta pourtant à bord afin d’en évacuer l’amiral Gar Stazy. Celui-ci, qui prévoyait de faire s’écraser son vaisseau sur les Sith pour causer un maximum de dégâts refusa de partir avec lui, mais le chef de l’escadron Rogue l’assomma sur l’ordre de Jaius Yorub. Le second de l'amiral, grièvement blessé, remplaça Stazi pour faire s’écraser l’Indomptable sur les défenses Sith, pendant que Bey évacuait Gar Stazi à bord de son appareil.

Une fois en sécurité, au lieu de sanctionner Bey, Gar Stazi le nomma comme officier en second en remplacement du capitaine Yorub décédé. C’est à ce poste, aux côtés de Gar Stazi, qu’il assista à la retransmission Holonet du massacre du sénat Mon Cal par Dark Krayt et ses hommes. L’Impérieux fut renommé l’Alliance, et Bey en devint commandant en second. Le nouvel adjoint de Stazi proposa de lancer une offensive sur Mon Calamari pour venir en aide à la population. Son supérieur refusa, conscient qu’ils n’avaient pas les moyens de défendre la planète. A la place, il choisit de s’attaquer au centre financier de l’Empire, la planète Ralltiir, pourtant lourdement défendue.

L’amiral Duros espérait pouvoir y récupérer des vaisseaux intacts pour agrandir sa flotte, mais ne pouvait lancer seul l’offensive. Une flotte envoyée par Roan Fel se joignit à l’Alliance, dirigée par l’arrogant amiral Fenel. Jhoram Bey assista à la conversation holographique entre Stazi et Fenel, apprenant que le plus grand fait de gloire de l’impérial était d’avoir éliminé des vaisseaux sans défenses lors de la bataille de Caamas.

Supérieurs en nombres, les alliés proposèrent au commandant de la flotte Sith, l’amiral Kelsan de se rendre. Celui-ci accepta, mais un jeune officier de sa flotte refusa, encourageant ses camarades à faire de même. Le comportement de Fenel, qui envoya ses vaisseaux pour détruire celui du fauteur de trouble mit le feu aux poudres, et les vaisseaux Sith se sabordèrent les uns après les autres. Alors que Fenel essayait de s’en prendre à la frégate d’où était partie l’insurrection en détruisant ses modules de survies, Stazi interposa sa propre flotte pour empêcher un massacre.

Sur l’ordre de Stazi qui tentait toujours de raisonner l’impérial, Bey envoya un message à Bastion pour informer Roan Fel du comportement de son officier. Alors que la situation devenait tendue entre les deux flottes alliées, Bey reçut une réponse de Bastion. Après une explication entre Stazi et l’empereur en exil, l’alliance entre l’Alliance Galactique et les loyalistes de Fel fut renouvelée, malgré une méfiance réciproque tenace. Toujours étonné par le comportement de Fenel, Bey hésita à croire en cette alliance, même lorsque Stazi lui eut expliqué qu’il ne s’agissait que d’un test de Roan Fel pour voir jusqu’où l’Alliance Galactique était prête à aller.

Aux côtés de Gar Stazi, envers lequel il était d’une loyauté sans faille, Jhoram Bey participa à toutes les batailles des Vestiges de l’Alliance Galactique contre les Sith.

Lors d’une reconnaissance de l’escadron Rogue dans le secteur de Mon Calamari, l’Alliance découvrit le résultat de la cruauté des Sith : des millions de corps flottants en orbite. Grâce à l’aide des Jedi, les forces de l’Alliance purent évacuer un grand nombre de Mon Cal en causant de lourdes pertes aux Sith, même si le virus lâché par Vul Isen anéantit plus de 80 % de la population. Bey participa également à la bataille en orbite de Taivas, la planète qui abritait le temple secret des Jedi survivants. Lorsque les Jedi apprirent que la localisation de la planète n’était plus secrète et que la flotte de Dark Krayt était en chemin, ils appelèrent Gar Stazi à l’aide.

Une flotte commandée par Morlish Veed et Rulf Yage ne tarda pas à se placer en orbite, commençant un violent bombardement planétaire et débarquant des troupes. Le tournant de la bataille intervint avec la défection de plusieurs unités de la flotte de Veed, dont le vaisseau du Moff Yage, qui rejoignirent les rangs de Roan Fel qui avait lui aussi répondu à l’appel des Jedi. La guerre entra dans sa dernière phase, et sous l’impulsion de Gar Stazi la flotte combinée de l’Alliance et de Fel attaqua Coruscant.