Dans les profondeurs de Coruscant, le prophète Yu'shaa, alias Nom Anor, annonce aux humiliés hérétiques Yuuzhan Vong qu'il a rêvé d'une planète vivante qui libérera les humiliés et causera la chute du Seigneur Suprême Shimrra.
Sur Dagobah, Tahiri est poursuivie par des guerriers Yuuzhan Vong. Elle en vient facilement à bout, avant d'aider un humilié Yuuzhan Vong mortellement blessé. Celui-ci lui explique qu'il est à la recherche de la planète de la prophétie de Yu'shaa. Il est venu sur Dagobah en espérant trouver celle-ci. Quand il demande à Tahiri s'il a rempli sa mission, elle préfère lui mentir en lui répondant que oui. Elle lui promet également d'aller voir le Prophète pour lui porter la nouvelle. L'humilié succombe ensuite dans ses bras.
Sur Coruscant, la modeleuse Nen Yim reçoit l'ordre d'étudier un vaisseau organique fait prisonnier lors de l'assaut contre Zonama Sekot. Nen Yim découvre vite que la conception du vaisseau est très proche de la biotechnologie Vong. Elle découvre également que les archives Vong contiennent les connaissances permettant de détruire cette technologie. Shimrra lui dit que la planète dont le vaisseau est originaire a été détruite, mais Nen Yim ne le croit pas. Décidée à en savoir plus sur Zonama Sekot, Nen Yim rencontre le prêtre Harrar qui lui conseille de se mettre en relation avec le prophète Yu'shaa. Lorsque Yu'shaa reçoit la requête de Nen Yim, il décide de demander l'aide des Jedi. Il leur envoie donc un message pour leur demander de le mener sur Zonama Sekot. Les Jedi acceptent et envoient Corran Horn et Tahiri Veila sur Coruscant à bord d'un vaisseau Vong volé.
Mais l'arrivée sur Corsucant est plus mouvementée que prévue, et leur vaisseau est mis hors d'usage. Bien qu'il ait accepté de faire équipe avec Tahiri, Corran se méfie d'elle depuis qu'elle a du fusionner avec la personnalité de Riina Kwaad et il s'en suit une explication plutôt mouvementée. Comme prévu, ils prennent contact avec le prophète Yu'shaa, mais Tahiri se méfie de lui car celui-ci porte un masque. Nom Anor leur explique alors qu'il a promis de garder ce masque jusqu'à ce que la prophétie s'accomplisse. Il évite ainsi d'être reconnu par les deux chevaliers Jedi. Ayant perdu leur vaisseau à leur arrivée sur Coruscant, les Jedi doivent maintenant s'en procurer un nouveau pour se rendre sur Zonama Sekot. Yu'Shaa informe les Jedi que la modeleuse Nen Yim peut leur en procurer un, s'ils acceptent de l'emmener avec eux. D'abord réticent, Corran n'a d'autre choix que d'accepter. Aidé par les humiliés hérétiques, le groupe attaque les quartiers de Nen Yim, et avec son aide s'empare du vaisseau de Zonama Sekot. Tahiri est blessée pendant l'assaut, et au moment du départ, le prête Harrar se joint subitement au groupe. Une fois en orbite de Corsucant, il apparaît vite que Nen Yim est incapable de piloter l'engin. Corran Horn prend alors les commandes, pendant que la modeleuse s'occupe de soigner Tahiri. Contrarié par les deux passagers imprévus, Nen Yim et Harrar, Corran annonce que le voyage vers Zonama Sekot est annulé et qu'ils se dirigent vers Mon Calamari pour discuter de cette nouvelle situation avec le Conseil Jedi. Il s'agit en fait d'un coup de bluff de Corran pour tester ses passagers Vong. Mais après plusieurs jours de voyage sans incident, Corran finit par leur révéler leur véritable destination. Au cours du trajet, le vaisseau doit échapper à un interdicteur impérial puis faire face à une rapide dégradation des moteurs du vaisseau, qui semblent mal supporter les implants Vong que Nen Yim a utilisé pour le remettre en état.
Après avoir repris Fondor en faisant diversion à Duro, les commandants de l’Alliance souhaitent reprendre Bilbringi afin de récupérer les chantiers navals et disposer d’une base de lancement pour une attaque sur le noyau.
Le flotte de Wedge Antilles arrive sur place mais lorsqu'elle tente de donner le feu vert aux deux autres flottes participant à l'opération, celles de Kre'fey et Pellaeon, le réseau Holonet reste muet. Coincée par un interdicteur Vong, la flotte du général Antilles se retrouve seule face à un ennemi plus nombreux. Cette panne du réseau de communication n'est pas du au hasard. C'est l'œuvre des Yuuzhan Vong qui ont développé une nouvelle arme capable de détecter et de mettre hors d'usage les émetteurs du réseau Holonet. L'Alliance se retrouve alors sans moyen de communication. Inquiet pour leur fille Jaina qui participe à l'attaque de Bilbringi, Yan et Leia Solo proposent d'utiliser le Faucon Millénium comme courrier pour contacter les flottes de Kre'fey et Pellaeon. Mais pendant leur trajet, Yan et Leia sont stoppés par le même interdicteur impérial qui avait bloqué l'expédition de Zonama Sekot. Après discussion avec son commandant, le capitaine Mynar Devis, le Faucon décide de rejoindre directement Bilbringi, escorté par plusieurs chasseurs TIE, avec le mystérieux capitaine Devis à leur tête. A Bilbringi, la situation est de plus en plus intenable pour Wedge Antilles qui décide d'envoyer Jaina chercher du secours. En passant, il la charge également d'inspecter une station de défense Golan qui semble toujours active. Jaina envoie Jagged Fel appeler les secours et choisit de s'occuper personnellement de l'inspection de la station. Mais à sa grande surprise, celle-ci se révèle occupée...
Corran, Tahiri, Nen Yim, Harrar et Yu'shaa finissent par arriver sur Zonama Sekot. L'atterrissage est brutal et détruit le vaisseau. Nen Yim commence ses analyses immédiatement. Pour aller plus vite, elle accepte l'aide de Yu'Shaa et lui donne accès à ses données. Les premiers résultats sont très surprenants. L'écosystème de Zonama Sekot est très proche de celui de la planète natale des Yuuzhan Vong, planète aujourd'hui disparue. Tahiri affirme alors que Zonama Sekot « est » la planète natale des Yuuzhan Vong. Nen Yim ne veut pas envisager cette hypothèse et préfère poursuivre ses recherches. Corran demande à Tahiri de les surveiller tous les deux, pendant que de son côté il part en reconnaissance avec Harrar. La Force est tellement présente sur Zonama Sekot, que ni Corran ni Tahiri ne parviennent à contacter Luke ou Jacen à travers elle. L'épave du vaisseau ne disposant pas de moyen de communication, ils doivent en trouver un pour faire connaître leur arrivée sur la planète. Toujours soucieux de mieux comprendre les motivations des infidèles, Harrar questionne Corran sur les raisons qui l'ont poussées à se battre en duel pour sauver Ithor et lui avoue qu'il a lui même considéré la destruction de la planète comme une erreur des Yuuzhan Vong. Malgré le fossé qui les sépare, un respect mutuel s'installe peu à peu entre Corran et Harrar. Pendant ce temps, Tahiri discute avec Nen Yim de la personnalité qui lui a été implantée pendant sa détention sur Yavin 4, celle de Riina Kwaad. Au cours de la discussion, il apparaît que les souvenirs de Riina sont également ceux de Nen Yim. Cette révélation choque cette dernière. A son retour, Corran a une nouvelle discussion avec Tahiri. Tahiri dit avoir besoin de continuer son apprentissage Jedi et lui demande de la prendre comme apprentie. D'abord réticent, Corran accepte à la condition qu'elle obéisse sans discuter aux ordres qu'il lui donnera. Tahiri accepte et devient l'élève de Corran. Pour comprendre le secret de la planète, Nen Yim a besoin de l'aide de Tahiri. L'opération réussit et Nen Yim découvre le lien entre Zonama Sekot et le peuple Yuuzhan Vong. Mais l'expérience l'a fatigué et elle a besoin de temps pour se reposer et réfléchir à ce qu'elle vient de découvrir. Pendant ce temps, Nom Anor contacte secrètement Shimrra. Il lui propose de détruire la planète et de tuer Nen Yim, Harrar et les deux chevaliers Jedi. En échange, il demande qu'on vienne le chercher et que le Seigneur Suprême lui pardonne ses précédents échecs. Shimrra accepte. Nom Anor passe donc à l'action en agressant Nen Yim et en lui volant l'arme qu'elle avait préparée au cas où la planète se serait avérée une menace pour le peuple Vong. Tahiri découvre Nen Yim blessée et mourante, mais avant de mourir celle-ci réussit quand même à la mettre en garde contre Yu'Shaa, qui n'est autre que Nom Anor, et contre ses projets de destruction de la planète. Nen Yim meurt dans les bras de Tahiri sans avoir pu lui révéler le secret de Zonama Sekot. Guidée par sa colère, Tahiri courre prévenir Corran et Harrar. Corran part immédiatement à la recherche de Nom Anor mais celui a déjà eu le temps de saboter la planète pour essayer de la faire exploser. Pendant sa fuite, Nom Anor tombe face à Tahiri et Harrar. Aveuglée par sa colère, Tahiri est mise rapidement hors combat et Nom Anor s'empare de son sabre laser avec lequel il tue Harrar. Corran et Tahiri finissent par le rattraper, mais il est trop tard, le vaisseau venu le chercher est déjà là, et trente guerriers Yuuzhan Vong se dressent devant eux. Soudain le sabotage de Nom Anor s'enclenche et la planète crie sa douleur à travers la Force. L'Ombre de Jade, avec à son bord Mara, Luke et Jacen, arrive rapidement sur place pour chercher la cause du problème et sont surpris de trouver là Corran et Tahiri. Malgré leurs efforts, les Jedi ne peuvent pas empêcher la fuite de Nom Anor. Le vaisseau impérial en orbite au tour de Zonama Sekot prend alors en chasse le vaisseau Vong, mais la planète saute soudain dans l'hyperespace.
Pour Wedge Antilles sur Bilbringi la situation est critique : les Yuuzhan Vong sont parvenus à brouiller leurs communications HoloNet et il n’est plus en mesure de contacter Kre’fey, ni Pellaeon qui devaient venir en renfort au moment critique de la bataille. Grâce à une station de défense Golan pilotée par des pirates et détournée par Jaina, la flotte de Wedge parvient finalement à s’enfuir mais de nombreux officiers sont capturés et envoyés sur la prison Yuuzhan Vong de Selvaris, parmi eux Pash Cracken et Judder Page.
Pendant ce temps sur Zonama Sekot, l'esprit de la planète apparaît à Tahiri sous la forme de Nen Yim, il explique aux Jedi qu'il a réussi à réparer le sabotage de Nom Anor, mais qu'il n'a pu empêcher le déclenchement de l'hyperpropulsion de la planète et qu'il ignore où et quand la planète va réapparaître dans l'espace réel. Il explique également que pendant son contact avec la modeleuse Nen Yim, il a pu enregistrer toutes les connaissances de celle-ci et qu'il connaît maintenant des secrets qui lui font se poser les questions les plus graves et les plus importantes de son existence. Il promet d'en parler plus tard lorsqu'il aura eu le temps d'y réfléchir plus longuement.