Kyle Katarn, l’ancien soldat impérial devenu mercenaire au service de la Rébellion, poursuit sa quête de savoir afin de comprendre pourquoi l'Empire a assassiné son père, Mortan Katarn. Evitant une embuscade posée par le droïde 8T-88, il finit par découvrir que son géniteur avait trouvé l'emplacement de la mythique Vallée des Jedi. A peine vient-il de décoder le message laissé par Mortan que détenait le droïde que Kyle prend rapidement conscience qu’une course contre la montre s’est engagée entre lui, les Impériaux et les chasseurs de primes. Kyle commence à prendre conscience de ses aptitudes à maîtriser la Force, mais les sept Jedi Noirs, qui sont tous sous les ordres du sinistre Jerec, sont déjà des maîtres du Côté Obscur, eux...

Le maléfique Jerec et ses troupes font route vers la planète Ruusan afin de s'emparer des ruines de la Vallée des Jedi. Le Jedi Sombre espère y trouver l'essence de milliers d'esprits de Jedi défunts. Ils furent emprisonnés il y a mille ans de cela, à la suite de la dernière grande bataille entre l’Ordre Jedi et la Confrérie des Sith. Son erreur a été d’annihiler un village de colons sur la planète isolée : alertée du massacre, l’Alliance envoie sur place Jan Ors et Kyle Katarn pour les arrêter. Ce dernier sait que l’heure de la confrontation entre lui et Jerec approche et le doute l’envahit. Ses compétences seront-elles en mesure d’égaler celle de son ennemi ? Selon l’esprit du Jedi Rahn, qui le guide depuis le début de sa quête, la réponse est oui.